1998 yılında Ankara Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi’ni bitirdikten sonra aynı fakültede Çocuk Diş Hekimliği Anabilim Dalı’nda doktora eğitimine başladı.
2005 yılında doktora eğitimini bitirdikten sonra aynı yıl Karadeniz Teknik Üniversitesi’nde yardımcı doçent ve kurucu anabilim dalı başkanı olarak çalışmaya başladı, sonraki yıl Ankara’ya Sağlık Bakanlığı’na döndü.
2009 yılı itibariyle TUKMOS Çocuk Diş Hekimliği Uzmanlık Eğitimi Komisyonu Üyeliğine atandı ve 2011 yılında Amerika Birleşik Devletleri’nde araştırmacı olarak görev aldı.
2013-2016 yılları arasında University of Amsterdam ve Vrije Universitiet Amsterdam’ın ortak diş hekimliği fakültesi olan ACTA AMSTERDAM’da doçent olarak 3.5 yıl çalıştı.
2016 yurda dönerek Altınbaş Üniversitesi’nde ana bilim dalı başkanı ve sağlık bilimlerinden sorumlu enstitü müdür yardımcısı olarak görev yaptı.
2021 yılında Dokuz Eylül Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi’ne Başhekim ve Anabilim Dalı Başkanı olarak atandı.
Çok sayıda ulusal ve uluslararası dergide editör, misafir editör ve yayın kurulu üyeliği yapan Buğra Özen, 2021 Ağustos ayından beri Profesör olarak İstanbul Sağlık ve Teknoloji Üniversitesi’nde Çocuk Diş Hekimliği Anabilim Dalı’nda öğretim üyeliği ve Enstitü Müdürlüğü görevlerini yürütmekte olup, İstanbul Bakırköy’de kendi kliniğinde de çalışmaktadır.